Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VWC2Q2TAL6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms