Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDO1Q16878 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDO1Q16878 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDO1Q16878 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDO1Q16878 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDO1Q16878 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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