Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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CTF1Q16619 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CTF1Q16619 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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