Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NEDD8Q15843 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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