Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNHIT3Q15649 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms