Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TCEA2Q15560 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms