Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYCP1Q15431 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYCP1Q15431 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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