Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM20Q15388 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM20Q15388 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms