Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms