Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PKP1Q13835 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PKP1Q13835 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PKP1Q13835 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PKP1Q13835 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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