Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1SQ13698 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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