Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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