Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BFSP2Q13515 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BFSP2Q13515 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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