Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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FOXE3Q13461 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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