Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PMS2P3Q13401 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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