Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3B2Q13367 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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