Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OC90Q02509 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OC90Q02509 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OC90Q02509 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OC90Q02509 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OC90Q02509 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OC90Q02509 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OC90Q02509 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OC90Q02509 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms