Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK17Q00537 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms