Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGDP52209 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGDP52209 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGDP52209 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms