Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RAB5CP51148 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RAB5CP51148 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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