Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms