Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCR1P46094 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCR1P46094 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms