Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGCXP38435 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGCXP38435 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms