Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF2P35227 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms