Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms