Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJB2P29033 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GJB2P29033 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms