Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms