Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HOXB4P17483 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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