Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IRF1P10914 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IRF1P10914 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF1P10914 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF1P10914 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF1P10914 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IRF1P10914 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF1P10914 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms