Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYNGR2O43760 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms