Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYNJ1O43426 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNJ1O43426 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms