Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBXN8O00124 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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