Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H3BNH8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H3BNH8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3BNH8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3BNH8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms