Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM149AA5PLN7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms