Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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SH3BP1Q9Y3L3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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