Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHANK2Q9UPX8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHANK2Q9UPX8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms