Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CLEC4AQ9UMR7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CLEC4AQ9UMR7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms