Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP25Q9UHP3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP25Q9UHP3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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