Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HCN3Q9P1Z3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms