Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIF1Q9H611 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms