Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
COMMD5Q9GZQ3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
COMMD5Q9GZQ3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms