Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms