Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms