Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms