Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUSP9Q99956 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DUSP9Q99956 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms