Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIC2Q96JB3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms