Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TM4SF18Q96CE8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms