Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ROPN1LQ96C74 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms