Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms