Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERVK_113Q902F9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms